Congresso Brasileiro de Microbiologia 2023 | Resumo: 609-1 | ||||
Resumo:INTRODUÇÃO: Corynebacterium rouxii é uma espécie recentemente descrita, pertencente ao complexo Corynebacterium diphtheriae e derivada do antigo biovar Belfanti de C. diphtheriae. Tem sido relatada em infecções cutâneas e peritoneais, não sendo adequadamente identificada por diagnósticos padrão e Espectrometria de Massas MALDI-TOF, o que definitivamente requer uma avaliação mais aprofundada pelos laboratórios.
OBJETIVO: Analisar as sequências completas dos genomas de duas cepas não toxigênicas de C. rouxii isoladas de lesão ulcerativa de gato no Brasil.
MÉTODOS: As extrações e purificações do DNA genômico foram realizadas, as bibliotecas foram preparadas e sequenciadas no MiSeq (Illumina, San Diego, USA). Os genomas foram montados de novo no software CLC Genomics Workbench e submetidos a análises de taxonomia genômica, rMLST, ANI e DDH in silico, para identificação da espécie. Adicionalmente, foram determinados os tipos de sequência (ST) e investigada a presença de genes de resistência e virulência, e do sistema CRISPR-Cas.
RESULTADOS: As cepas foram, inicialmente, identificadas por Espectrometria de Massas MALDI-TOF (99% de probabilidade) como C. diphtheriae, porém, pelo banco de dados rMLST, concluiu-se serem C. rouxii com 95% de similaridade. ANI e dDDH in silico foram consistentes com valores acima dos pontos de corte e corroboraram com a identificação e as análises de rMLST revelaram um novo ST. Nenhum gene de resistência de transferência horizontal foi predito, nenhuma mutação foi detectada nos genes constitutivos gyrA e rpoB, o gene tox não foi encontrado, mas seu gene regulador dtxR estava presente. Entre os genes de virulência preditos estão os envolvidos na captação de ferro. O sistema CRISPR-Cas tipo I-E foi detectado em ambos os genomas.
CONCLUSÃO: Este é o primeiro estudo genômico de C. rouxii na América Latina. Realizamos análises taxonômicas, predição de fatores de virulência e análises genômicas que podem ajudar a entender a potencial patogênese de cepas não toxigênicas desta espécie.
Palavras-chave: Corynebacterium diphtheriae, Corynebacterium rouxxi, Sequenciamento genômico |